在深圳灣口岸深圳一側，香港文匯報記者看到地鐵13號線在口岸附近有三個出入口，其中C口最近深圳灣口岸入境大廳，其次為B口，更接近改造後的出租車上客區。目前，深圳市軌道交通13號線一期工程南段（深圳灣口岸站至高新中站）已順利通過項目工程驗收，正在進行空載試運行，預計年內開通初期運營。

根據記者實測，深圳灣口岸地鐵出行將最便捷，地鐵13號線C出口步行至口岸區域僅100米左右，其次為私家車、網約車上客區，步行約200米，旅客還可在景觀集散廣場等候，舒適的等候體驗感大幅增加。通過科學合理的規劃與施工安排，實現口岸形象的全面提升與交通組織的優化。

地鐵13號線是支持後海中心、科技園片區、留仙洞總部基地重點建設地區發展的中部地區南北向骨幹線。線路南起深圳灣口岸站，北至上屋站，全長約22.4公里，設站16個，其中換乘站12個。該線是全自動運行線路，列車採用GoA4級全自動無人駕駛列車運行控制系統，最高運行速度為100km/h。