【諾貝爾獎】Google AI創辦人等英美三傑奪化學獎




  創造全新蛋白質助藥物研發 AI模型快速預測兩億種結構

  香港文匯報訊 生命體旺盛的化學反應源自蛋白質的貢獻。科學家們完全理解和掌握蛋白質的美好願望,如今觸手可及。今屆諾貝爾化學獎分別授予科企Google轄下人工智能(AI)企業DeepMind創辦人哈薩比斯和高級科學家詹珀,表彰他們利用AI模型「AlphaFold2」,預測人類世界幾乎所有兩億個已知蛋白質的結構;亦授予美國華盛頓大學生物化學家貝克,表彰他利用電腦技術輔助創造全新的蛋白質。

  蛋白質分子通常由20種氨基酸組成,組合方式千變萬化。1960年代以來,研究人員主要使用一種名為「X射線晶體學」的方式,確認蛋白質結構。科學家們發現,蛋白質的三維結構完全由其氨基酸序列決定,但一個蛋白質可能的結構種類多達10的47次方,如果氨基酸鏈是隨機摺疊,單是分析一種蛋白質的結構,就要耗費較宇宙年齡還要長的時間,窮舉尋找答案。

  準確預測蛋白質三維結構

  伴隨研究進展,人們發現知道蛋白質的氨基酸序列後,可分析其不同部分作用力,預測蛋白質的結構。1994年,一項名為「蛋白質結構預測批判性評估」(CASP)的競賽誕生,全球各地的科學家們定期相聚「猜謎」,謎面是一種蛋白質的氨基酸序列,謎底則要依照該序列,預測蛋白質的三維結構。

  2018年,哈薩比斯團隊利用AI模型AlphaFold參加CASP競賽,其預測準確率接近60%,以絕對優勢奪冠。不過要將準確率提升到90%以上,需要詹珀的協助,推出全新版本AlphaFold2,將所有已知蛋白質結構和氨基酸序列資料庫,全部用於AI訓練。2020年競賽中,AlphaFold2的準確率幾乎與X射線晶體學一致,相較後者需耗時數月甚至多年,AI只需幾分鐘便能給出結果。

  Top7人造蛋白質改變世界

  人們知曉蛋白質的結構,又能否創造新的蛋白質?1990年代,貝克開始研發預測蛋白質結構的電腦軟件Rosetta,他思考如果反向利用軟件,輸入需要的蛋白質結構,由軟件輸出構建氨基酸序列的建議,或許能創造出新的蛋白質。

  在貝克團隊的努力下,一款名為「Top7」的人造蛋白質問世,它由93個氨基酸組成,結構極為穩定,與任何天然蛋白質都不相同,自此打開「從頭設計蛋白質」世界的大門。這意味着科學家們想要設計有特定功能的蛋白質,除調整天然蛋白質結構外,還可以從零開始將它製造出來。

  諾貝爾獎委員會稱,截至本月,全球有來自190個國家超過200萬人使用過AlphaFold2,人類探索蛋白質結構的效率已大幅提升,更可以自行創造蛋白質,其成果在納米材料作標靶藥和疫苗等領域都能發揮作用。貝克將獲得1,100萬瑞典克朗(約827萬港元)獎金的一半,另一半由哈薩比斯和詹珀平分。

  貝克(David Baker)

  出生日期及地點:1962年10月(62歲)美國華盛頓州西雅圖

  任職機構:美國華盛頓州華盛頓大學

  獲獎原因:利用電腦技術設計全新蛋白質

  獎金份額:50%

  哈薩比斯(Demis Hassabis)

  出生日期及地點: 1976年7月(48歲)英國倫敦

  任職機構:Google DeepMind

  獲獎原因:利用AI技術預測蛋白質結構

  獎金份額:25%

  詹珀(John M. Jumper)

  出生日期及地點:1985年(39歲)美國阿肯色州小石城

  任職機構:Google DeepMind

  獲獎原因:利用AI技術預測蛋白質結構

  獎金份額:25%