對於兒童為何出現「長新冠」，專家主要根據多個不同理論推斷原因，當中包括炎症導致器官功能障礙、腸胃敏感導致殘留病毒滲漏，以及免疫系統的過敏反應。

有理論認為兒童和成人長新冠成因相同，包括處於休眠狀態的病毒被重新激活、殘留的病毒作祟，或病毒誘導的自身抗體攻擊身體組織等，亦有理論指病毒會導致循環系統受損。德國德累斯頓工業大學的阿曼醫生指出，目前普遍認為成人長新冠是由於身體出現炎症，令微小血管產生變化導致器官功能出現障礙，但目前對兒童的相關研究仍未有足夠數據。

美國耶魯大學附屬醫院新冠康復項目兒科醫生奧利維拉則指出，研究發現在大部分兒童長新冠患者的血液內，均發現一種顯示腸道出現滲漏的物質，表示患者的消化系統有腸道微生物滲入血液情況。奧利維拉推測，新冠病毒對部分腸胃敏感的兒童而言可能更像腸胃疾病。雖然兒童及成人都能將殘留病毒排出體外，但若患者出現腸道滲漏，可能因再次接觸殘留病毒引起炎症。奧利維拉稱若推測正確，只要測試新冠康復兒童的腸漏情況，就可得知是否患上長新冠。

亦有意見指兒童長新冠或與免疫系統過敏有關，莫斯科謝切諾夫大學醫生芒布利特正研究免疫系統與長新冠的易感性是否存有聯繫，認為抵禦入侵病毒的Th1細胞與負責生產抗體的Th2細胞之間失衡，導致對病毒或其他刺激的過度反應，可能是兒童長新冠的成因。 ◆綜合報道