【特稿】歷時2年繪就全細胞「地圖」

◆研究團隊自主研發了DNBelab C4便攜式單細胞系統,結合DNBSEQ測序平台於2020年開始推動細胞圖譜工作。圖為研究人員使用DNBelab C4進行測試 。 受訪者供圖
◆研究團隊自主研發了DNBelab C4便攜式單細胞系統,結合DNBSEQ測序平台於2020年開始推動細胞圖譜工作。圖為研究人員使用DNBelab C4進行測試 。 受訪者供圖

  非人靈長類動物全細胞「地圖」的繪製,離不開單細胞測序技術的進步和測序成本的下降。在過去,要繪製這樣一張「地圖」,需要大量的時間及高昂的實驗成本。而如今,基於華大智造自主研發的單細胞建庫平台(DNBelab C4)和DNBSEQ測序技術,世界各地的領域專家及科研工作者可以以低成本、高通量、高靈敏度和準確性的方法進行大規模的單細胞測序分析,為整個生命科學領域提供了一系列寶貴的數據資源。

  用國產化設備掌控成本

  「2018年下半年,我們停止了進口設備的採購,用了半年時間自主研發了DNBelab C4便攜式單細胞系統,結合DNBSEQ測序平台,可實現便攜式、即時化、一站式單細胞組學研究全流程。」深圳華大生命科學研究院單細胞組學領域首席科學家、文章通訊作者劉龍奇接受媒體採訪時回憶道,有了國產化設備的底氣,掌握了工具材料和掌控成本,就在2020年開始着手推動細胞圖譜的工作。

  如此大規模的圖譜研究,必然需要全球的科學家共同參與。劉龍奇表示,這個項目有全球35個科研團隊的參與,是一個以大科學項目方式進行運營的。研究團隊在產出圖譜數據後,共涉及了45個不同的器官,每一個器官都是一個巨大的領域,需要不同的專家,「所以我們主動跟國際上不同領域非常頂級的專家進行合作,也得到了非常多的回應,大家一起對器官進行聯合解讀,在整個過程中我們交了非常多的國際朋友,這對於未來的大科學項目來講,也是非常重要的。」

  意大利夥伴多次往返深圳

  在2年多的研究期間,恰逢新冠病毒全球爆發。劉龍奇提到,意大利的研究合作夥伴,在疫情期間多次往返,每次到深圳都是隔離近一個月的時間,在這種情況下對方還堅持不懈地多次往返。另一個在中科院廣州健康院的合作夥伴,這兩年中近一半的時間待在國家基因庫,聯合解讀數據,非常不容易,大家都在爭分奪秒開展工作。◆香港文匯報記者 郭若溪 深圳報道